Jeg benytter meg av denne for dette formålet:
https://github.com/bourgeoislab/gpxlabSiden gpx-filer kun er xml, så kan du også fjerne transportetapper manuelt med en tekstleser, eller ved hjelp av python.
For å gjøre det manuelt så kan du benytte noe annet med kart-funksjon og finne det punktet (og klokkeslett/lokasjon) for start av transportetappen,
så finner du også det punktet hvor den stopper.
Nå åpner du gpx-filen i en tekstleser og søker etter start-tidspunktet. Her i fra så markerer du alle <trkpt></trkpt> til du treffer på slutt-tidspunktet.
Slett så feltene, og lagre filen, og du har fjernet transportetappen manuelt og kan legge den ut på trailguide.